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病原菌即病原微生物（Pathogenic Bacterium），是一種引起疾病的微生物，能入侵宿主引起感染的微生物，例如病毒、細(xì)菌、真菌等。
近日，CelLoud生物信息分析云平臺(tái)成功入駐中國疾病預(yù)防控制中心（CDC），為傳染病檢測(cè)和研究提供數(shù)據(jù)分析服務(wù)。
在感染病分子診斷中，基因檢測(cè)技術(shù)（包括PCR技術(shù)、sanger技術(shù)、高通量測(cè)序技術(shù)、全基因組測(cè)序技術(shù)等）可以幫助實(shí)現(xiàn)檢測(cè)病原菌種屬類型、監(jiān)控流行病的爆發(fā)、預(yù)測(cè)耐藥性、促進(jìn)疫苗研發(fā)并對(duì)個(gè)體患者診斷、治療提供新的建議或方案。也可通過檢測(cè)病原菌的種屬類型，從而針對(duì)性的實(shí)施個(gè)體化治療或針對(duì)性開發(fā)治療該病原菌的微生物制劑。
CelLoud云平臺(tái)為中國疾病預(yù)防控制中心關(guān)于SARS、禽流感H5N1，豬鏈球菌，新布尼亞病毒，禽流感H7N9等等傳染病學(xué)研究提供在線基因數(shù)據(jù)生信分析流程。提高數(shù)據(jù)分析準(zhǔn)確性的同時(shí)也大大的縮短的分析周期，為疫情預(yù)防提供了更充裕的準(zhǔn)備時(shí)間。
同時(shí)，利用通過高通量測(cè)序技術(shù)（NGS）對(duì)細(xì)菌16S rDNA的全長(zhǎng)序列進(jìn)行測(cè)序，并對(duì)數(shù)據(jù)庫中的標(biāo)準(zhǔn)序列進(jìn)行比對(duì)分析，確定細(xì)菌的種屬類型，從而為患者的個(gè)性化治療提供參考。
病原菌基因檢測(cè)技術(shù)適應(yīng)人群：
ü 血培養(yǎng)顯示陰性的感染患者，包括敗血癥、心內(nèi)膜炎、骨髓炎；
ü 感染了苛求菌或不可培養(yǎng)的微生物的患者；
ü 由于免疫抑制劑導(dǎo)致了對(duì)廣泛病原體易感的患者；
ü 深層感染需要?jiǎng)?chuàng)傷性活組織檢查的患者。
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